Востановление каталогов Windows выбирать нужно, но в том случае, если начальная загрузка проходит до меню вариантов загрузки системы. У меня 2 или 3 часа мусолилось все, но восстановилось.
И еще одно - если с диска каталоги восстанавливаются, то не желательно, чтоб слетевшая система сильно обновлена была.