Можно попробовать сделать это с помощью какого-нибудь LiveCD с соответствующим софтом (естественно, сделав предварительно backup); если же проблемы с местом из-за файлов пользователей (сомнительно, чтобы постоянно устанавливались новые программы) - то проще перенести их на другой раздел/диск.