Начисление делается документом начисление зарплаты. В 8.2 все было хорошо. При чем здесь распределение прямых и косвенных?
в 8.2 тоже с весны не нормально.
план счетов изменился
здесь 1С совсем не причем. Они все правильно делают. почитайте изменени по отчислением.