Обычно такой вирус сидит в ОП компа сразу до загрузки антивируса, т.е. распространяет свой код с памяти на другие носители.
Нужно удалить все ключи загрузки из реестра и в софт-режиме проверить комп AVZ + Cureit. Ну и запретить автозапуск со всех носителей )