Тоже очень интересно, как заставить работать web-клиент с сервером 1с установленном на линуксе. Пробовал патчить с помощью 1с8_uni3patch файлик backbus.so, он патчится но web-клиент все равно просит ключик.
У меня ubuntu server крутится на виртуальной машинке и я пока просто реализовал проброс в нее юсб порта через usbip. Но как-то не очень стабильно этот проброс работает и периодически 1с перестает видеть ключ.