Да все можно но смотреть надо там для того чтобы налоги попали в книгу доходов и расходов необходимы условия - заработная плата относится к деятельности по УСН и налоги начислены и они же уплочены т.е. вы начислили зар плату и налоги и платежным поручением их оплатили и только в этом случае они попадут в книгу. Что касается НДФЛ он тоже попадает после оплаты. А заработная плата у вас попала потому что вы ее выдали - создали РКО. Т.е. при УСН не забывайте про кассовый метод ведения учета.