Тогда установи контроль уникальности номеров в пределах подчинения
Вы наверное что-то путаете. "В пределах подчинения" это по реквизиту "Владелец" (т.е. это только для справочников у которых установлен признак подчиненности), а выше речь шла о "группах", т.е. о реквизите "Родитель".