В конфигураторе нигде праздники не настраиваются. Вся информация о праздничных днях сохраняется в регистре сведений "Регламентированный производственный календарь". В данном регистре храниться информация по каждому календарному дню ресурс "Вид дня" определяет праздничный, предпраздничный, выходной или рабочий день. В вашем случае лучше всего смотреть конечно обработку, но рискну предположить что в вашем случае виной всему график работы по сотруднику, возможно по сотруднику в графике указано что данный день рабочий.