Где именно не указывается?
В Чеке ККМ? там будет ставится цена в зависимости от того как указано в виде цен Розничная. Сначала добавится просто цена, а когда нажать расчет то посчитается и НДС, если в виде цен стоит "Включая НДС" - НДС будет виден только в печатной форме; если не стоит "Включая НДС", то при расчете цена увеличится на НДС, и к оплате будет уже она.