По сути, свертка базы - это формирование остатков на какую-то дату. Т.е. в новую базу перенесутся остатки (по складам, контрагентам, материалам или еще по каким аналитикам), соответственно, что сформировало такие остатки видно не будет. Объясните это своим пользователям, если их это устроит, то делайте свертку базы и перегружайте. Возможны и варианты, например свертка базы на 1.01.2014 и перенос всех документов позже этой даты.