Собственно вопрос, что будет с лицензиями? Это уже не локальные пользователи будут, а пользователи домена.
А какое отношение система лицензирования 1С имеет к системе управления учетными записями? Не морочьте голову ни себе, ни окружающим
Или лицензионный ключ устанавливается для всех пользователей компьютера, в независимости от их принадлежности и я могу спокойно вводить в домен компы и все будет работать?
Читайте у 1С документацию по системе лицензирования и не путайте лицензии "на сервер" и "на рабочее место"