Смотри документ "Распределение расходов на себестоимость", правило распределения и какие движения он делает, куда-то он всё равно должен распределять. Посмотри ещё может у тебя включен - списание расходов по методу "директ-костинг".
Без бухгалтерии не могу сказать как что работает, у меня всё сразу и зп и бух и производство в одной.