полно софтинок и сервисов в сети для восстановления (пример http://www.oemailrecovery.com/ru/pdf_recovery.html )
а так надо смотреть, что именно поломалось - какие ошибки выдаются по мимо вашей, что делали, какой троян был. а то может троян на прощанье всё зашифровал или вовсе забил нулями.
как вариант - если есть возможность - выложите пдф-файл, попробуем на него посмотреть.