если саму прорамму купили официально, никаких кряков, эмуляторов и патчей нет, лицензия от программного продукта дает право использования данной конфигурации, то значит все нормально - у вас используется лицензионный программный продукт.
Чтобы ответить подробнее, то уточните, используете типовую конфигурацию 1С:Розницы или какую-нибудь специализированную? Какую версию 1С:Розницы купили, Базовую или Проф? Если Проф, то с USB ключом или с программной защитой?