Ну-у-у... При слиянии у вас первая задача это слияние справочников физ лиц.

Насчет кадровой истории, так если человек работал в организации А, а теперь работает в организации Б, то для истории он все равно работал в А. Поэтому копия базы а "на момент слияния" "замораживается" и доступна "для чтения". А вот с организацией Б как вариант (сказать более точно сложно так как непонятна целая куча нюансов):
- в организации Б создаются аналогичные организации А подразделения (даже если есть аналогичные типа Бухгалтерия) - создать "отдельное" "Бухгалтерия компании А":
- далее переносите кадровую историю сотрудников компании А в компанию Б, через создания приказов о приеме и кадровых перемещениях в эти созданные подразделения "задним числом". Ясное дело, что уволенных на дату слияния переносить не нужно.
- после переноса сотрудников ,переносите соответствующие расчета для среднего (тут собственно говоря нужно только последние несколько лет для больничных) и отпуска.

Ну типа все... Работы много, но задача вполне решаемая :blush: