Да нет, перезагрузил сервер, тормознул лишние процессы, обновил базу на новую конфигурацию.
Попробовал опять тонким клиентом синхронизацию со стороны бухгалтерии, та же ошибка.
Попробовал толстым клиентом, синхронизация прошла.
Тормознул сервер 1С, сделал обслуживание базы средствами утилиты pgAdmin 3.
Стартанул опять сервер 1С.
Запустил тонким клиентом, синхронизация на этот раз прошла.
Похоже, 32-х разрядный сервер доживает своё.
Файловые базы работают, а вот уже SQL-ным уже ресурсов не хватает.