Объявление массива нужно делать раньше
Код:
РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
    МассивАртикулов = Новый Массив();
    Если Не РезультатЗапроса.Пустой() Тогда
        ВыборкаДетальныеЗаписи = РезультатЗапроса.Выбрать();
        Пока ВыборкаДетальныеЗаписи.Следующий() Цикл
            МассивАртикулов.Добавить(ВыборкаДетальныеЗаписи.НоменклатураАртикул);
        КонецЦикла;
    КонецЕсли;
    
    Возврат МассивАртикулов;
И перед прохождением по массиву сделать проверку
Код:
Если Не МассивАртикулов.Количество() = 0 Тогда