как привязать договор А к счету А а договор Б к счету Б по оному контрагенту?

[alexandr_ll]

у нас контрагент допустим есть у него есть два договора. один договор с одним расчетным счетом второй договор с гос заказом. приходится выбирать вручную то есть ставить основной на который мы хотим.

Без доработки не получится. Можно написать расширение, которое будет использовать дополнительные реквизиты справочника "Договоры", в которые следует внести соответствующий расчетный счет контрагента. В этом случае в основную конфигурацию никаких изменений вносить не придется. Цена вопроса - в фрилансе.