выдрал с каого-то форума:

1. Берем диск с 2003 .
2 ставим дис в привод на контроллере с 2000 (master домена)
3. run -cmd - том привода\i386\adprep /ForestPrep
если все нормально adprep /domainprep
далее:
на 2003
run -dcpromo делаем машину доп. контроллером домена.
ждем репликации - либо принудительно ее запускаем.
перенос роли мастера домена с 2к на 2003
Все.