Под ХР проблема перенастройки решалась обновлением драйверов IDE контроллера до стандартных(в клинических случаях телодвижениями с boot.ini), вот до замены материнки можно было сделать то же с Vista, но я лично сомневаюсь что оно завелось бы по причине того что Vista ведет себя с драйвера несколько иначе чем ХР, думаю что старые драйвера от старой материнки в системе сделают погоду.