У меня похожая ситуация была недавно. По терминалу все работали нормально, а зайти на сервер не могли. Пока все компы в сетке каспером не прогнал, так и мучились работники. Нашёл бекдоров и троянов охапку. После удаления вирусни и жесткой раздачи всем айпишников ситуация стабилизировалась.