Попробуй проверить винт на ошибки и битые сектора, какой нибудь софтинкой. Например MHDD(НО ТОЛЬКО СКАН БЕЗ ДОПОЛНИТЕЛЬНЫХ АТРИБУТОВ) Если не поможет то можно попробывать отследить сам процесс копирования/сканирования - возможно косяк происходит на одном и том же файле(скорее всего архиве *.rar*).
Антивирь желательно выключить на время копирования(для чистоты эксперимента)
Антивирь часом не Каспер?