А попробуй в настройках восстановления сервера убрать галочку (правый клик на Мой Компьютер - Свойства Системы - Дополнительно - Загрузка и Восстановление - Параметры) на Выполнить автоматическую перезагрузку.
Будет он уходить в BSOD или нет. Если уйдет в BSOD берем карандашик и бумажку ну или фотик, и записываем все аккуратно.
У меня подозрение, что во время копирования файлов на сетевую шару, сетка отрубается и файлы тупо грузятся в память\своп, а когда она перегружается сервер сбрасывает память. В любом случае если он БСОДить будет, то это проблема в памяти\сетке.